Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIP1P30622 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms