Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms