Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRHP20396 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRHP20396 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRHP20396 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRHP20396 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRHP20396 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRHP20396 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms