Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HPGDP15428 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HPGDP15428 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HPGDP15428 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HPGDP15428 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms