Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms