Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms