Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms