Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B4DGG1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DGG1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DGG1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DGG1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DGG1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DGG1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms