Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRRM4A7MD48 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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