Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms