Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms