Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms