Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms