Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms