Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms