Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms