Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms