Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MEPEQ9NQ76 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MEPEQ9NQ76 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms