Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf50Q9BV19 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms