Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR3CQ9BUI4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms