Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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NIPSNAP1Q9BPW8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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NIPSNAP1Q9BPW8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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NIPSNAP1Q9BPW8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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NIPSNAP1Q9BPW8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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