Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUP88Q99567 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms