Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms