Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF4Q96M43 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms