Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC136Q96JN2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms