Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA7

TONSL, Tonsoku-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TONSLQ96HA7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TONSLQ96HA7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms