Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms