Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP4Q969X6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms