Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00523Q86TU6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms