Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE16Q7Z3T8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms