Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms