Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF123Q5XPI4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms