Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q5VSD8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q5VSD8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms