Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GREB1Q4ZG55 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms