Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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NRF1Q16656 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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NRF1Q16656 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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NRF1Q16656 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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NRF1Q16656 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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NRF1Q16656 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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NRF1Q16656 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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NRF1Q16656 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRF1Q16656 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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