Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FXNQ16595 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FXNQ16595 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FXNQ16595 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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