Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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ALX1Q15699 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ALX1Q15699 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ALX1Q15699 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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ALX1Q15699 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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