Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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