Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms