Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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