Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTK7Q13308 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTK7Q13308 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTK7Q13308 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTK7Q13308 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTK7Q13308 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTK7Q13308 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTK7Q13308 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTK7Q13308 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms