Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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