Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms