Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMDP50402 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMDP50402 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMDP50402 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMDP50402 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMDP50402 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMDP50402 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMDP50402 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms