Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms