Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RGS4P49798 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RGS4P49798 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms