Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPGP40121 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms