Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms