Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC175P0C221 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms