Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 CPNE1-226ENST00000486021 506 ntTSL 28.24□□□□□ -1.091e-11■■■■■ 108.6
SF3B1O75533 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 108.6
SF3B1O75533 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 108.5
SF3B1O75533 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 215.45■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 108.5
SF3B1O75533 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.754e-6■■■■■ 108.5
SF3B1O75533 ESS2-202ENST00000434568 1808 ntTSL 521.32■■□□□ 13e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 MIRLET7BHG-202ENST00000381051 875 ntTSL 221.21■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 ESS2-204ENST00000472073 2101 ntTSL 518.8■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 AGAP3-203ENST00000461065 1707 ntTSL 1 (best)16.48■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-205ENST00000471583 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-208ENST00000479335 1615 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.035e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-204ENST00000469165 1158 ntTSL 37.83□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-202ENST00000460526 794 ntTSL 37.83□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-203ENST00000468382 829 ntTSL 57.14□□□□□ -1.275e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-207ENST00000478014 618 ntTSL 37.01□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.335e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-219ENST00000554244 669 ntTSL 36.11□□□□□ -1.435e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-216ENST00000553595 795 ntTSL 34.52□□□□□ -1.695e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-214ENST00000497460 546 ntTSL 43.7□□□□□ -1.825e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 RAD51B-213ENST00000492236 417 ntTSL 32.51□□□□□ -2.015e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 108.4
SF3B1O75533 DDHD1-208ENST00000556910 599 ntTSL 45.34□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 108.3
SF3B1O75533 SMARCAD1-207ENST00000510105 2409 ntTSL 515.96■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 108.3
SF3B1O75533 GOLGA8B-203ENST00000484716 6114 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 108.3
SF3B1O75533 GOLGA8B-210ENST00000569100 6488 ntTSL 510.7□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 108.3
SF3B1O75533 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 108.2
SF3B1O75533 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 108.2
SF3B1O75533 LEPROTL1-207ENST00000520739 559 ntTSL 45.04□□□□□ -1.64e-6■■■■■ 108.1
SF3B1O75533 EIF2D-203ENST00000437518 920 ntTSL 39.86□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 108.1
SF3B1O75533 CNOT2-206ENST00000547780 582 ntTSL 523.16■■□□□ 1.34e-7■■■■■ 108
SF3B1O75533 CNOT2-238ENST00000552422 443 ntTSL 37.19□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 108
SF3B1O75533 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.485e-6■■■■■ 108
SF3B1O75533 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 108
SF3B1O75533 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 108
SF3B1O75533 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 108
SF3B1O75533 NOP56-209ENST00000469588 950 ntTSL 222.86■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 108
SF3B1O75533 NOP56-203ENST00000445139 856 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 108
SF3B1O75533 NOP56-217ENST00000494697 919 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 108
SF3B1O75533 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 108
SF3B1O75533 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 108
SF3B1O75533 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 108
SF3B1O75533 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 108
SF3B1O75533 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 108
SF3B1O75533 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)7.01□□□□□ -1.294e-8■■■■■ 108
SF3B1O75533 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 108
SF3B1O75533 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.045e-6■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.463e-13■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPS3A-209ENST00000510993 762 ntTSL 514.16□□□□□ -0.143e-13■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.923e-13■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.453e-13■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.723e-13■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPS3A-205ENST00000507327 674 ntTSL 23.6□□□□□ -1.833e-13■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPS3A-211ENST00000512797 686 ntTSL 23.44□□□□□ -1.863e-13■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPS3A-213ENST00000515792 671 ntTSL 32.11□□□□□ -2.073e-13■■■■■ 108
SF3B1O75533 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.073e-13■■■■■ 108
SF3B1O75533 SREBF1-214ENST00000486311 473 ntTSL 324.72■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 SREBF1-212ENST00000478616 882 ntTSL 520.51■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 SREBF1-213ENST00000485080 1230 ntTSL 519.33■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 CUL9-218ENST00000515773 8150 ntTSL 211.29□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 CUL9-202ENST00000372647 7684 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 MIR3936HG-203ENST00000616965 607 ntTSL 57.27□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 NUDCD3-204ENST00000464812 811 ntTSL 59.56□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 107.9
SF3B1O75533 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 522.53■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 107.8
SF3B1O75533 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 422.35■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 107.8
SF3B1O75533 ZNF282-202ENST00000470381 733 ntTSL 235.77■■■■□ 3.321e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.81e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.71e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 C11orf80-209ENST00000527368 812 ntTSL 525.58■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 C11orf80-202ENST00000524551 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.89■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 C11orf80-217ENST00000534325 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.78■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 INTS10-210ENST00000521357 876 ntTSL 517.69■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 TATDN3-216ENST00000533650 417 ntTSL 317.21■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 TATDN3-203ENST00000488246 498 ntTSL 213.16□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 C11orf80-211ENST00000531400 367 ntTSL 313.11□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 DPM1-202ENST00000371584 1073 ntTSL 512.89□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 107.7
SF3B1O75533 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 107.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1621.3 ms